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活動記録

研究室の学術論文・学会発表・学位論文を年度別にまとめています。2019年度以前の記録は researchmap をご覧ください。

2026年度

学会発表

日本コンピュータ化学会 春季年会2026年6月4日〜5日 — 東京科学大学 大岡山キャンパス

  • 口頭発表山本 典史 「紙で作った分子パズルで育むコンピュータ化学への興味:初等教育から高大接続に至る化学教育の実践」
  • ポスター発表斎藤 喬 「ホタル生物発光における発光体–酵素間相互作用と発光色制御機構の理論的解析」
  • ポスター発表古志 華絵 「ホタル人工発光基質の高輝度化に向けた非断熱遷移過程に関する理論的解析」
  • ポスター発表多田 健太郎 「インスリンの動的構造における鎖間ジスルフィド結合とセレン置換効果の理論的解析」
  • ポスター発表西村 望 「多孔性配位高分子ELM-12におけるアセチレン吸着挙動の理論的検討」
  • ポスター発表中村 梨花 「金属有機構造体ZIF-8のCO₂吸着能に対するアミノ基修飾効果の理論的解析」
  • ポスター発表廣岡 隼人 「ゴム加硫プロセスにおける酸化亜鉛の架橋促進効果に関する理論的解析」
  • ポスター発表糸賀 翼 「量子・古典ハイブリット法を用いたPFAS分解反応に関する理論的解析」
  • ポスター発表小島 来夢 「緑色蛍光タンパク質GFPにおける発光中心の電子状態に関する理論的解析」

分子科学討論会2026年9月15日〜18日 — くにびきメッセ(松江)

  • ポスター発表糸賀 翼 「スピン制約型SQD法による強相関分子のエネルギー計算精度向上」
  • ポスター発表松原 颯希 「ホタル発光色進化の分子機構:祖先型・現生型ルシフェラーゼのQM/MM-MD解析」
  • ポスター発表古志 華絵 「AkaLumine生物発光における低発光量子収率の分子機構:非断熱分子動力学解析」
  • ポスター発表斎藤 喬 「ホタルルシフェラーゼ変異体における生物発光色変化の分子機構:QM/MM-MD解析」

2025年度

論文

  1. 山本 典史 「分子シミュレーションが切り開くガスハイドレート対策の最前線」, ペトロテック, 49, 169-175 (2026).
  2. 山本 典史 「小さな手たちが組み立てる化学の未来:分子パズルPuzMol(パズモル)を活用した理系人材育成の試行錯誤」, フロンティア(理論化学会誌), 8, 3-9 (2026).
  3. Cherumannil Femina, Norifumi Yamamoto, Nelliyulla Kappumchalil Ramya, Pookkottu K. Sajith, Reji Thomas 「Photophysical divergence driven by π-spacer variations in the anthracene–cyanostilbene architecture」, Physical Chemistry Chemical Physics, 27, 24641-24654 (2025).DOI
  4. Cherumannil Femina, Toshiya Yamagami, Norifumi Yamamoto, Reji Thomas, Pookkottu K. Sajith 「Theoretical insights into aggregation-induced emission of bis(cyanostyryl)pyrrole derivatives」, Physical Chemistry Chemical Physics, 27, 8478-8487 (2025).DOI

学会発表

日本コンピュータ化学会 春季年会2025年6月5日〜6日 — 東京科学大学 大岡山キャンパス

  • ポスター発表惠村 学斗 「加硫反応における架橋構造がゴム分子の力学物性に及ぼす影響に関する理論的研究」
  • ポスター発表古志 華絵 「人工発光基質–ホタルルシフェラーゼ複合体の生物発光反応に関する理論的研究」
  • ポスター発表斎藤 喬 「ホタル発光基質–変異型ホタルルシフェラーゼ複合体の生物発光反応に関する理論的研究」
  • ポスター発表秋葉 はな 「構造変化型多孔性配位高分子ELM-11の二酸化炭素吸着メカニズムに関する理論的研究」
  • ポスター発表勝又 僚汰朗 「SARS-CoV-2スパイクタンパク質–ユニバーサル中和抗体の分子間相互作用に関する理論的研究」
  • ポスター発表小池 歩 「アミロイドβペプチドの配列長依存的な構造転移および会合機構に関する理論的研究」
  • ポスター発表松原 颯希 「ホタル発光酵素–ホタルルシフェラーゼ複合体における生物発光反応のpH依存性に関する理論的研究」
  • ポスター発表神子 唯 「ゴム分子架橋形成過程における酸化亜鉛触媒の加硫反応促進効果に関する理論的研究」

分子科学討論会2025年9月9日〜12日 — 広島国際会議場

  • ポスター発表斎藤 喬 「ホタルルシフェラーゼ変異型と発光基質の相互作用が導く生物発光色制御」
  • ポスター発表古志 華絵 「人工発光基質アカルミネのAkaluc変異体を用いた生物発光における高輝度化メカニズム」
  • ポスター発表山上 隼弥 「三脚巴状分子の凝集誘起発光における非断熱遷移ダイナミクス」
  • ポスター発表松原 颯希 「ホタル生物発光の起源を探る:発光タンパク質の分子進化メカニズム」

日本生物物理学会2025年9月24日〜26日 — 奈良県コンベンションセンター

  • 招待講演山本 典史 「分子シミュレーションで探るホタルの太古の光」
  • ポスター発表勝又 僚汰朗 「インフルエンザウイルス・ノイラミニダーゼの薬剤耐性機構に関する理論的研究:酵素反応の自由エネルギープロファイル解析」
  • ポスター発表小池 歩 「Aβ凝集における相互作用ダイナミクスの解明:Aβ40/Aβ42各種会合状態の比較」
  • ポスター発表藤巻 竣 「ALSにおけるSOD1の構造動態・金属結合部位の反応性・毒性機構に関する理論的解析」
  • ポスター発表山瀨 桂大 「D30N/L90M変異を持つHIV-1プロテアーゼにおける薬剤耐性メカニズムの解明:残基間相互作用ネットワーク解析」

日本コンピュータ化学会 秋季年会2025年11月7日〜8日 — 岐阜市文化センター

  • ポスター発表秋葉 はな 「構造変化型多孔性配位高分子ELM-11の二酸化炭素吸着メカニズムに関する理論的研究」
  • ポスター発表会田 翔哉 「タイヤエラストマーの加硫戻り過程における硫黄架橋の熱分解メカニズム」
  • ポスター発表神子 唯 「タイヤエラストマーの硫黄加硫初期過程における環状硫黄の開環メカニズム」
  • ポスター発表惠村 学斗 「タイヤエラストマーの硫黄加硫成熟過程におけるポリスルフィド架橋の脱硫メカニズム」

学位論文

  • 修士論文会田 翔哉 「タイヤエラストマーの加硫戻りにおける硫黄架橋熱分解メカニズム」
  • 修士論文藤巻 竣 「筋萎縮性側索硬化症原因タンパク質SOD1の毒性発現機構」
  • 修士論文山上 隼弥 「三脚巴状分子の凝集体構造における非断熱遷移ダイナミクス」
  • 修士論文山瀨 桂大 「HIV-1プロテアーゼの残基間相互作用ネットワーク動力学」
  • 卒業論文糸賀 翼 「量子・古典ハイブリッド法によるPFAS分解機構解明に向けた基礎検討:ノイズ耐性と計算精度に関する理論的解析」
  • 卒業論文小島 来夢 「緑色蛍光タンパク質GFPの発光機構に関する理論的解析:周辺アミノ酸残基の影響と水分子の重要性に関する考察」
  • 卒業論文高安 真由 「イクオリンの発光色制御メカニズムに関する理論的解析:活性部位における静電場とプロトン化状態の相関」
  • 卒業論文藤野 莉子 「海洋生物由来発光タンパク質の基質特異性:ウミシイタケおよびオワンクラゲの比較解析」
  • 卒業論文田中 ゆうこ 「グルココルチコイド受容体の動的構造特性に関する理論的解析:ミネラルコルチコイド受容体との比較による可塑性の評価」
  • 卒業論文多田 健太郎 「インスリンの構造安定性における分子間ジスルフィド結合の役割とセレン置換効果に関する理論的解析」
  • 卒業論文吉田 桃子 ポーシャ 「アルツハイマー病関連アミロイドβはタウ凝集体の安定化因子か:ADおよびCBD由来タウの動的構造比較による理論的解析」
  • 卒業論文廣岡 隼人 「ゴム加硫プロセスにおける酸化亜鉛の役割に関する理論的解析:プロトン受容メカニズムに着目して」
  • 卒業論文芳賀 優梨 「大気浄化に向けたZIFおよびMIL系MOFのNOx吸着挙動に関する理論的解析:細孔構造と吸着性能の相関」
  • 卒業論文中村 梨花 「ZIF-8のCO2吸着能に対するアミノ基修飾の効果に関する理論的解析:物理・化学吸着モデルに基づく定量的評価」
  • 卒業論文西村 望 「多孔性配位高分子ELM-12のアセチレン吸着における対イオンの役割と特異的相互作用に関する理論的解析」

2024年度

論文

  1. Masaki Honda, Naoya Miyakawa, Norifumi Yamamoto 「Photosensitized Z-isomerization of (all-E)-carotenoids by a natural sensitizer riboflavin (vitamin B2): Experimental and quantum chemistry studies」, Biochemical and Biophysical Research Communications, 757, 151625 (2025).DOI

学会発表

分子科学討論会2024年9月18日〜21日 — 京都大学 吉田キャンパス

  • ポスター発表與五澤 蓮 「三脚巴状分子の凝集誘起発光ダイナミクスに関する理論的解析」
  • ポスター発表尾保手 颯汰 「ホタル生物発光の分子進化メカニズムに関する理論的解析」
  • ポスター発表宮川 直也 「リコピンのシス–トランス光異性化ダイナミクスに関する理論的解析」
  • ポスター発表宮本 勇人 「HIV-1プロテアーゼの薬剤耐性化メカニズム:残基間相互作用ネットワーク解析」
  • ポスター発表山上 隼弥 「ジシアノスチルベン誘導体の凝集誘起発光メカニズムに関する理論的解析」
  • ポスター発表竹内 健人 「SOD1変性過程に関する理論的研究:銅イオンと亜鉛イオンの解離に伴う残基間相互作用の変化」

日本生物物理学会2024年6月24日〜28日 — 国立京都国際会館

  • ポスター発表藤巻 竣 「Theoretical Insights into Conformational Changes in SOD1 Involved in the Pathological Mechanism of Amyotrophic Lateral Sclerosis: Residue Interaction Network Analysis」
  • ポスター発表山瀨 桂大 「Theoretical Insights into Drug Resistance Mechanisms of HIV-1 Protease: Residue Interaction Network Analysis」

学位論文

  • 修士論文新井 翔大 「ゴムの架橋反応におけるジチオカルバミン酸塩系加硫促進剤の触媒作用に関する理論的解析」
  • 修士論文井出 隼哉 「ゴムの架橋反応におけるチアゾール系加硫促進剤の触媒作用に関する理論的解析」
  • 修士論文岡崎 祐太 「積層型多孔性配位錯体のゲート型吸着メカニズムに関する理論的解析」
  • 修士論文尾保手 颯汰 「ホタル生物発光の分子進化メカニズムに関する理論的解析」
  • 修士論文鹿草 悠樹 「インフルエンザウイルスノイラミニダーゼの酵素反応メカニズムに関する理論的解析」
  • 修士論文佐藤 麻央 「フラーレンと湾曲型多環分子からなる複合系の光化学的性質に関する理論的解析」
  • 修士論文竹内 健人 「SOD1の毒性発現メカニズム:金属イオンの脱離に伴う SOD1 の構造異常化」
  • 修士論文冨永 樹生 「ミオシンのATP加水分解反応プロセスに関する理論的解析」
  • 修士論文深沢 斗夢 「SOD1の毒性発現メカニズム:分子内ジスルフィド結合の解離に伴う状態異常化」
  • 修士論文宮川 直也 「リコピンの光異性化メカニズムに関する理論的解析」
  • 修士論文宮本 勇人 「HIV-1プロテアーゼの薬剤耐性化メカニズム:残基間相互作用ネットワーク解析」
  • 修士論文與五澤 蓮 「三脚巴状分子の凝集誘起発光ダイナミクスに関する理論的解析」
  • 卒業論文神子 唯 「ゴム分子架橋形成過程における酸化亜鉛触媒の加硫反応促進効果に関する理論的研究」
  • 卒業論文惠村 学斗 「加硫反応における架橋構造がゴム分子の力学物性に及ぼす影響に関する理論的研究」
  • 卒業論文秋葉 はな 「構造変化型多孔性配位高分子ELM-11の二酸化炭素吸着メカニズムに関する理論的研究」
  • 卒業論文高橋 洸翔 「C型肝炎ウイルスgenotype 1aにおける薬剤耐性メカニズムに関する理論的研究」
  • 卒業論文田村 ニナ 「C型肝炎ウイルスgenotype 1bにおける病態進行メカニズムに関する理論的研究」
  • 卒業論文小池 歩 「アミロイドβペプチドの配列長依存的な構造転移および会合機構に関する理論的研究」
  • 卒業論文勝又 僚汰朗 「SARS-CoV-2スパイクタンパク質-ユニバーサル中和抗体の分子間相互作用に関する理論的研究」
  • 卒業論文古志 華絵 「人工発光基質-ホタルルシフェラーゼ複合体の生物発光反応に関する理論的研究」
  • 卒業論文松原 颯希 「ホタル発光酵素-ホタルルシフェラーゼ複合体における生物発光反応のpH依存性に関する理論的研究」
  • 卒業論文斎藤 喬 「ホタル発光基質-変異型ホタルルシフェラーゼ複合体の生物発光反応に関する理論的研究」

2023年度

論文

  1. Masafumi Ueda, Midori Kuramochi, Riho Shimizu, Yuki Ohba, Norifumi Yamamoto, Yasuhiro Mazaki 「Benzocoumarin-Fused Triskelions Exhibit AIEE Due to Inhibited Molecular Inversion」, European Journal of Organic Chemistry, 27, e202400015 (2024).DOI

学会発表

分子科学討論会2023年9月12日〜15日 — 大阪大学 豊中キャンパス

  • ポスター発表古川 航希 「3-ヒドロキシフラボン誘導体の二重蛍光プロセスに関する理論的解析」
  • ポスター発表與五澤 蓮 「テトラフェニルエチレンの凝集誘起発光ダイナミクスに関する理論的解析」
  • ポスター発表佐藤 麻央 「2,4-ジニトロアニリン誘導体の凝集状態における発光特性に関する理論的解析」
  • ポスター発表大場 勇希 「三脚巴状分子とその誘導体の螺旋反転ダイナミクスに関する理論的解析」
  • ポスター発表尾保手 颯汰 「原初ホタルの生物発光メカニズムに関する理論的解析」
  • ポスター発表佐久間 将也 「ホタルをモデルにした人工発光基質の生物発光過程に関する理論的解析」
  • ポスター発表宮川 直也 「リコピンのシス–トランス光異性化反応に関する理論的解析」

日本生物物理学会2023年11月14日〜16日 — 名古屋国際会議場

  • ポスター発表宮本 勇人 「HIV-1プロテアーゼの薬剤耐性機構に関する理論的研究:残基相互作用ネットワーク解析」
  • ポスター発表村田 寛和 「SARS-CoV-2スパイクタンパク質とユニバーサル中和抗体との相互作用:残基間相互作用ネットワークに基づく理論的解析」
  • ポスター発表橋本 隆希 「HIV-1逆転写酵素の薬剤耐性機構に関する理論的研究:残基相互作用ネットワーク解析」
  • ポスター発表竹内 健人 「SOD1変性過程に関する理論的研究:銅イオンと亜鉛イオンの解離に伴う残基間相互作用の変化」
  • ポスター発表深沢 斗夢 「SOD1変性過程に関する理論的研究:分子内S–S結合の解離に伴う残基間相互作用の変化」
  • ポスター発表冨永 樹生 「QM/MM分子シミュレーションによるミオシンのATP加水分解反応機構に関する理論的研究」
  • ポスター発表鹿草 悠樹 「インフルエンザウイルス・ノイラミニダーゼの薬剤耐性機構に関する理論的研究:残基相互作用ネットワーク解析」

日本コンピュータ化学会 秋季年会2023年11月24日〜26日 — レクザムホール(高松)

  • ポスター発表新井 翔大 「ゴムの架橋反応におけるジチオカルバミン酸塩系加硫促進剤の触媒作用:量子化学計算を用いた理論的解析」
  • ポスター発表井出 隼哉 「ゴムの架橋反応におけるチアゾール系加硫促進剤の触媒作用:量子化学計算を用いた理論的解析」
  • ポスター発表松村 乙矢 「金属有機構造体ZIF-7の構造転移ダイナミクスを解析するためのニューラルネットワーク力場の開発」
  • ポスター発表井上 友希 「金属有機構造体MIL-53内におけるゲスト分子の拡散挙動:第一原理計算由来の分子力場を用いた理論的解析」
  • ポスター発表江野澤 晃宏 「ピレン系金属有機構造体における二酸化炭素の触媒反応メカニズム:量子化学計算に基づく理論的解析」
  • ポスター発表岡崎 祐太 「ELM-11積層型多孔性配位錯体の構造転移ダイナミクス:分子動力学シミュレーションを用いた理論的解析」

学位論文

  • 修士論文井上 友希 「金属有機構造体 MIL-53 におけるゲスト分子の拡散挙動:第一原理計算由来の分子力場を用いた理論的解析」
  • 修士論文江野澤 晃宏 「ピレン系金属有機構造体における二酸化炭素の触媒反応メカニズムに関する理論的解析」
  • 修士論文大場 勇希 「三脚巴状分子とその誘導体の螺旋反転ダイナミクスに関する理論的解析」
  • 修士論文佐久間 将也 「ホタルをモデルにした人工発光基質の生物発光過程に関する理論的解析」
  • 修士論文橋本 隆希 「HIV逆転写酵素の薬剤耐性変異化のメカニズム:残基間相互作用ネットワークに基づく理論的解析」
  • 修士論文古川 航希 「3-ヒドロキシフラボン誘導体の二重蛍光プロセスに関する理論的研究」
  • 修士論文松村 乙矢 「金属有機構造体 ZIF-7 の構造転移ダイナミクス:ニューラルネットワークポテンシャルを用いた理論的解析」
  • 修士論文村田 寛和 「SARS-CoV-2スパイクタンパク質とユニバーサル中和抗体の相互作用:残基間相互作用ネットワークに基づく理論的解析」
  • 卒業論文会田 翔哉 「加硫促進剤による環状硫黄の開環反応促進メカニズムに関する理論的解析」
  • 卒業論文大津 壮陽 「加硫促進剤によるゴム分子の架橋形成促進のメカニズムに関する理論的解析」
  • 卒業論文高梨 純也 「弾性的層構造をもつ有機金属構造体の気体吸着性に関する理論的解析:ゲスト分子で異なる吸着特性」
  • 卒業論文染谷 友介 「弾性的層構造をもつ有機金属構造体の気体吸着性に関する理論的解析:骨格構造で異なる吸着特性」
  • 卒業論文神 昌来 「カロテノイド類の生物活性発現メカニズムに関する理論的解析:構造転移のプロセス」
  • 卒業論文古賀 梨名 「湾曲型多環分子とフラーレンからなる複合系の光化学的性質に関する理論的解析」
  • 卒業論文黒田 一真 「分子生成AIを用いた人工発光基質の自動設計手法の開発」
  • 卒業論文山上 隼弥 「凝集誘起発光を示すπ拡張三脚巴状分子の光化学的性質に関する理論的解析」
  • 卒業論文山瀨 桂大 「HIV-1の薬剤耐性化メカニズムに関する理論的解析:一次変異による薬剤感受性への影響」
  • 卒業論文吉田 諒 「HIV-1の薬剤耐性化メカニズムに関する理論的解析:多剤耐性獲得のプロセス」
  • 卒業論文藤巻 竣 「筋萎縮性側索硬化症の病態メカニズムに関する理論的解析:SOD1タンパク質の構造変化」

2022年度

論文

  1. Masafumi Ueda, Mirai Kokubun, Nao Yanagi, Norifumi Yamamoto, Yasuhiro Mazaki 「Janus-Type AIE Fluorophores: Synthesis and Properties of π-Extended Coumarin-Bearing Triskelions」, Molecules, 27, 7450 (2022).DOI

学会発表

分子科学討論会2022年9月19日〜22日 — 慶應義塾大学 矢上キャンパス

  • ポスター発表古川 航希 「3-ヒドロキシフラボン誘導体の励起状態プロトン移動反応に関する理論的研究」
  • ポスター発表柳 南帆 「三脚巴状分子の凝集誘起発光過程に関する自由エネルギープロファイル解析」
  • ポスター発表佐久間 将也 「ホタルをモデルにした人工発光基質の生物発光メカニズムに関する理論的研究」
  • ポスター発表大場 勇希 「三脚巴状分子の螺旋反転過程に関する自由エネルギープロファイル解析」
  • ポスター発表酒井 祐輔 「テトラフェニルエチレンの凝集誘起発光過程に関する自由エネルギープロファイル解析」

日本生物物理学会2022年9月28日〜30日 — 函館アリーナ・函館市民会館

  • ポスター発表尾島 彩夏 「HIV-1のNelfinavir耐性プロテアーゼD30N/N88D変異体に対する動的残基間相互作用ネットワーク解析」
  • ポスター発表村田 寛和 「新型コロナウイルスのスパイクタンパク質の動的残基相互作用ネットワーク分析」
  • ポスター発表橋本 隆希 「HIV逆転写酵素の薬剤耐性変異に対する動的残基間相互作用ネットワーク解析」
  • ポスター発表宮脇 綾我 「HIV-1のNelfinavir耐性プロテアーゼD30N/L90M変異体に対する動的残基間相互作用ネットワーク解析」

日本コンピュータ化学会 秋季年会2022年11月25日〜27日 — 信州大学 長野キャンパス

  • ポスター発表福嶋 一晃 「ニューラルネットワークポテンシャル力場を用いた金属有機構造体の分子動力学シミュレーション」
  • ポスター発表米津 直弥 「量子化学計算に基づいて生成する経験力場を用いた金属有機構造体(MOF)の分子動力学シミュレーション」

日本化学会 春季年会2023年3月22日〜25日 — 東京理科大学 野田キャンパス

  • ポスター発表松村 乙矢 「ニューラルネットワークポテンシャル力場を用いた金属有機構造体の分子シミュレーション」
  • ポスター発表井上 友希 「金属有機構造体における二酸化炭素の拡散挙動に関する理論的解析」

学位論文

  • 修士論文酒井 祐輔 「テトラフェニルエチレンの凝集誘起発光メカニズムに関する理論的研究」
  • 修士論文柳 南帆 「三脚巴状分子の凝集誘起発光メカニズムに関する理論的研究」
  • 修士論文米津 直弥 「金属有機構造体における二酸化炭素の拡散・吸着メカニズムに関する理論的研究」
  • 修士論文福嶋 一晃 「ニューラルネットワークポテンシャル力場を用いた金属有機構造体の分子動力学シミュレーション」
  • 修士論文宮脇 綾我 「HIV-1プロテアーゼD30N/L90M変異体の薬剤耐性メカニズムに関する理論的研究」
  • 修士論文尾島 彩夏 「HIV-1プロテアーゼD30N/N88D変異体の薬剤耐性メカニズムに関する理論的研究」
  • 卒業論文岡崎 祐太 「有機金属錯体を用いた亜酸化窒素の分離技術に関する理論的研究」
  • 卒業論文新井 翔大 「有機金属構造体を用いた水素ガスの貯蔵技術に関する理論的研究」
  • 卒業論文井出 隼哉 「有機金属構造体を用いた二酸化炭素ガスの分離技術に関する理論的研究」
  • 卒業論文鹿草 悠樹 「インフルエンザウイルスの薬剤耐性化メカニズムに関する理論的研究」
  • 卒業論文宮本 勇人 「HIVの薬剤耐性化メカニズムに関する理論的研究」
  • 卒業論文山本 志帆 「新型コロナウイルスの変異に伴う感染性や抗原性の変化に関する理論的研究」
  • 卒業論文深沢 斗夢 「筋萎縮性側索硬化症の発症機序に関する理論的研究:SOD1のアミノ酸変異過程」
  • 卒業論文冨永 樹生 「筋萎縮性側索硬化症の発症機序に関する理論的研究:SOD1のジスルフィド結合切断過程」
  • 卒業論文竹内 健人 「筋萎縮性側索硬化症の発症機序に関する理論的研究:SOD1の脱金属過程」
  • 卒業論文小森谷 優丞 「機械学習を用いた農薬の毒性予測に関する理論的研究」
  • 卒業論文樋口 萌子 「機械学習による医薬品開発のための肝毒性予測に関する研究」
  • 卒業論文宮川 直也 「アントシアニンのハロクロミズムに関する理論的研究」
  • 卒業論文尾保手 颯汰 「原初ホタルの生物発光メカニズムに関する理論的研究」
  • 卒業論文佐藤 麻央 「2,4-ジニトロアニリン誘導体の凝集誘起発光に関する理論的研究」
  • 卒業論文與五澤 蓮 「エチレンの非断熱遷移ダイナミクスに関する理論的研究」

2021年度

論文

  1. Kota Honda, Rintaro Fujikawa, Xiao Ma, Norifumi Yamamoto, Kota Fujiwara, Akiko Kaneko, Yutaka Abe 「The formation and growth model of a CO2 hydrate layer based on molecular dynamics」, AIChE Journal, 68 (2022).DOI
  2. Norifumi Yamamoto, Genichi Sampei, Gota Kawai 「Free-Energy Profile Analysis of the Catalytic Reaction of Glycinamide Ribonucleotide Synthetase」, Life, 12, 281 (2022).DOI
  3. Mohini Yadav, Manabu Igarashi, Norifumi Yamamoto 「Theoretical insights into the molecular mechanism of I117V mutation in neuraminidase mediated reduction of oseltamivir drug susceptibility in A/H5N1 influenza virus」, PeerJ Physical Chemistry, 3, e19 (2021).DOI
  4. Mohini Yadav, Manabu Igarashi, Norifumi Yamamoto 「Dynamic residue interaction network analysis of the oseltamivir binding site of N1 neuraminidase and its H274Y mutation site conferring drug resistance in influenza A virus」, PeerJ, 9, e11552 (2021).DOI
  5. Kei Moritsugu, Norifumi Yamamoto, Yasushige Yonezawa, Shin-ichi Tate, Hiroshi Fujisaki 「Path Ensembles for Pin1-Catalyzed Cis–Trans Isomerization of a Substrate Calculated by Weighted Ensemble Simulations」, Journal of Chemical Theory and Computation, 17, 2522-2529 (2021).DOI
  6. Norifumi Yamamoto 「Free energy profile analysis to identify factors activating the aggregation-induced emission of a cyanostilbene derivative」, Physical Chemistry Chemical Physics, 23, 1317-1324 (2021).DOI

学会発表

分子科学討論会2021年9月18日〜21日 — オンライン開催

  • 口頭発表Mohini Yadav 「Dynamic residue interaction network analysis of the H274Y mutation in neuraminidase conferring drug resistance in influenza virus」
  • ポスター発表柳 南帆 「クマリンを有する三脚巴状分子の凝集誘起発光についての理論的研究」

日本生物物理学会2021年11月25日〜27日 — オンライン開催

  • 口頭発表尾島 彩夏 「Dynamic Residue Interaction Network Analysis of Secondary Mutations in Protease that Promote Drug Resistance in HIV-1」
  • 口頭発表Mohini Yadav 「Dynamic residue interaction network analysis of the H274Y mutant in neuraminidase conferring drug resistance in influenza virus」
  • 口頭発表宮脇 綾我 「Dynamic Residue Interaction Network Analysis of Primary Mutations in Protease that Confer Drug Resistance in HIV-1」

日本コンピュータ化学会 秋季年会2021年11月2日〜3日 — オンライン開催

  • ポスター発表柳 南帆 「三脚巴状分子の凝集誘起発光メカニズムについての理論的研究」

日本化学会 春季年会2022年3月23日〜26日 — オンライン開催

  • ポスター発表酒井 祐輔 「テトラフェニルエチレンの凝集誘起発光についての理論的研究」
  • ポスター発表米津 直弥 「金属有機構造体MIL-101(Cr)を用いた高炉ガスからのCO₂分離・回収技術に関する理論的研究」
  • ポスター発表柳 南帆 「三脚巴状分子の凝集誘起発光メカニズムについての理論的研究」

学位論文

  • 博士論文Mohini Yadav 「Theoretical study on the molecular mechanism of drug resistance in influenza A viruses」
  • 卒業論文大場 勇希 「三脚巴状分子の構造転移過程に関する理論的研究」
  • 卒業論文佐久間 将也 「ホタルルシフェリン誘導体の励起状態に関する理論的研究」
  • 卒業論文古川 航希 「3-ヒドロキシフラボン誘導体の励起状態に関する理論的研究」
  • 卒業論文松本 英士 「架橋アゾベンゼン誘導体の励起状態に関する理論的研究」
  • 卒業論文江野澤 晃宏 「IRMOF-14におけるCO2吸着挙動に関する理論的研究」
  • 卒業論文石川 拓海 「MOF-177におけるCO2吸着挙動に関する理論的研究」
  • 卒業論文松村 乙矢 「ZIF-8におけるCO2吸着挙動に関する理論的研究」
  • 卒業論文湯浅 将悟 「コンピュータ支援を活用した学習意欲を高めるための化学教材の開発」
  • 卒業論文萩原 李音 「分子の形と性質の概念を主体的に学ぶことを支援する新たな学習教材の開発:分子の構造から融点・沸点を予測する」
  • 卒業論文寒風 晴菜 「分子の形と性質の概念を主体的に学ぶことを支援する新たな学習教材の開発:分子の構造からlogPを予測する」
  • 卒業論文佐藤 芹菜 「HIVのインテグラーゼ阻害剤に対する薬剤耐性化メカニズムについての理論的研究」
  • 卒業論文海谷 美里 「HIVのプロテアーゼ阻害剤に対する薬剤耐性化メカニズムについての理論的研究」
  • 卒業論文橋本 隆希 「HIVの逆転写酵素阻害剤に対する薬剤耐性化メカニズムについての理論的研究」

2020年度

論文

  1. Yoshinori Shibanuma, Naoki Nemoto, Norifumi Yamamoto, Gen-Ichi Sampei, Gota Kawai 「Crystal structure of adenylate kinase from an extremophilic archaeon Aeropyrum pernix with ATP and AMP」, The Journal of Biochemistry, 168, 223-229 (2020).DOI
  2. Norifumi Yamamoto 「Free Energy Profile Analysis for the Aggregation-Induced Emission of Diphenyldibenzofulvene」, The Journal of Physical Chemistry A, 124, 4939-4945 (2020).DOI

2019年度以前の記録はresearchmapをご覧ください。